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A pesar de que los pagos fueron asumidos y ejecutados durante el mandato de Sebastián Piñera, varios sólo fueron regularizados durante el Gobierno del Presidente Boric.
Durante el segundo Gobierno de Sebastián Piñera, la Universidad San Sebastián (USS) experimentó un significativo aumento en sus ingresos provenientes de organismos públicos, superando los $7 mil millones. Buena parte de estos fondos provino de contratos con el Ministerio de Salud, que pagó $1.010 millones por el procesamiento de exámenes PCR durante la pandemia de Covid-19. Adicionalmente, se comprometieron $2.500 millones más en servicios no regularizados antes del cambio de Gobierno, de los cuales se pagaron $1.200 millones en 2022.
Una investigación de Ciper reveló que entre 2018 y 2021, el Ministerio de Salud y sus servicios dependientes emitieron más de 120 órdenes de compra a la USS por un total de $2.169 millones, situando a la universidad entre los principales proveedores del Estado en 2021. La mayoría de estos ingresos provino del procesamiento de muestras PCR, lo que posicionó a la USS como una de las instituciones que más pruebas de Covid-19 analizaba en 2020.
En particular, un contrato firmado en noviembre de 2021 con el Servicio de Salud Metropolitano Norte establecía el procesamiento de 10.500 exámenes mensuales, con un costo fijo de $5 mil por muestra. La USS aseguró que este acuerdo representaba solo el 4% de sus ingresos por servicios.
Figuras clave del manejo de la pandemia durante el gobierno de Piñera, como el exministro de Salud Enrique Paris y el exsubsecretario de Redes Asistenciales Arturo Zúñiga, se integraron posteriormente a la USS en cargos de relevancia. Paris asumió la presidencia del Instituto de Políticas Públicas en Salud (IPSUSS) y Zúñiga fue nombrado vicerrector de Admisión y Desarrollo Estudiantil. Ambos participaron en la gestión de recursos hacia los laboratorios de la universidad durante la pandemia. Zúñiga, sin embargo, negó haber realizado gestiones para la USS durante su mandato.
Además, la investigación reveló que en septiembre pasado la Subsecretaría de Educación emitió órdenes de compra por $1.479 millones a la USS, por programas de formación docente durante la gestión de Marcela Cubillos como ministra de Educación.
Los pagos estatales a la USS alcanzaron su punto máximo en 2022, con $2.843 millones, regularizando contratos pendientes del gobierno anterior: a pesar de que varios de esos contratos fueron ejecutados durante el mandato de Sebastián Piñera, no fueron regularizados sino hasta asumido el Presidente Gabriel Boric en 2022. Contraloría advirtió del hecho, señalando que en ocasiones posteriores “esa institución deberá oportunamente suscribir y sancionar los convenios como el de la especie”.
La universidad puso en operaciones tres laboratorios para el análisis de muestras en 2020, llegando a analizar 1.300 diarias, los que situaron a la casa de estudios como la segundo que más muestras analizaba ese mismo año, además de ser de las pocas que continuaron siendo contratadas en 2021 y 2022. Esto le valió citados contratos por un total $3.564 millones de pesos.
